1956年,Theodore Puck从中国仓鼠中分离出的卵巢细胞(Chinese Hamster Ovary,CHO),凭着耐受强、重组基因扩增和表达高效等特性,成为生产蛋白类药物的shouxuan宿主。
作为新药和新疫苗开发的全球lingjun企业,GSK(葛兰素史克)便瞄准到中国仓鼠卵巢细胞(CHO)培养工艺的开发中,计划用于生产单克隆抗体。
而规模化生产抗体等生物药的关键,在于在人工控制条件下的生物反应器中悬浮培养细胞。
由于活性产物会在细胞内经历复杂的生物反应,要想最大限度提高产量和质量,首先需要量化CQA与CMA、CPP的关系:
CQA(关键质量属性):
活细胞浓度,活性百分比,营养素(例如葡萄糖),代谢物(例如谷氨酰胺),单抗滴度等
CMA(关键物料属性):
细胞特性,培养基成分等
CPP(关键工艺参数):
进料策略(时间、剂量),pH,温度,溶氧度等
尤其对于CHO细胞而言,其代谢特点是葡萄糖和谷氨酰胺摄取率高,以及乳酸和铵盐的代谢副产物分泌率高。其中乳酸如果超标,不但会抑制细胞生长和蛋白质产生,甚至会导致细胞死亡。
减少乳酸最常用的方法,就是控制培养基中的葡萄糖含量,让其尽可能达到培养zuijia浓度(过高不完全氧化产生乳酸、过低则会影响细胞生长和产能),这就需要对葡萄糖的消耗与需求、乳酸的生产速率,以及目的蛋白的表达量等多组参数进行综合考虑,并平衡葡萄糖和Gln的比例,调整进料策略。
在过去,传统工艺开发方式,一般会花费大量时间、财力、人工成本来设计和实施海量实验,走弯路难以避免,且投入产出比往往很低。
为了高效优化生物反应器控制和补料策略等设定点,最大化高质量产品的生产,GSK迫切期望利用新的方法工具,加速实验设计和细胞培养工艺的探索进程。
模型落地三步走,让策略优化少走弯路
纵观整个生物制药行业,为了减少实验负担,用机理模型来模拟细胞培养过程动力学,逐渐成为了行业发展的一种趋势。虽然一直以来,人们对于细胞培养动力学建模的学术研究十分活跃,但这些模型尚未在工业中广泛采用,且许多企业至今仍然缺乏非专家可以使用的工具。
如何破解细胞培养工艺难题?从哪里开始入门?西门子PSE制药行业专用的工艺数字孪生软件gPROMS FormulatedProducts,吸引到了GSK的注意。
多年来,通过快速配置、校准和部署基于科学的、数据校准的数字孪生,gPROMS FormulatedProducts内置有完备的细胞培养动力学模型,可以对工艺上下游进行综合、全面的分析,帮助了许多国际zhiming制药企业,快速、轻松汲取来自专业文献中的知识,解决实际生产难题。
合作伊始,GSK经过西门子制药团队的专业培训和技术支持,系统地学习了机理建模方法,并决定通过三步走的方式,让数字模型在现实培养场景中落地生根、开花结果:
第一步:模型选择
针对CHO细胞培养过程,GSK采用了描述细胞在单一有机底物下生长和代谢过程的Monod细胞反应动力学模型。
GSK所借助的Monod模型由14个方程和25个参数组成,如表征细胞的比生长速率与限制性底物浓度之间关系方程等,能全面描述CHO细胞的补料分批环境。
Monod模型中的有代表性的公式
通过建立这些方程,GSK得以对整个培养和生产过程,包括对细胞生长、死亡、裂解,细胞分泌的副产物(如氨、乳酸等)变化速率,传质、传热和能量消耗等复杂过程,进行框架描述和参数求解。
用方程表达数据联系,对于将数据转化为可用知识、加快企业技术转移、工艺放大大有裨益。
当然,除了软件中预定义的模型外,gPROMS FormulatedProducts中的模型自定义功能,还可以让工艺开发者自由展开二次开发,以探索更新颖的机理模型、捕捉更复杂的现象、拓展更多可能性。
第二步:模型校准和验证
当生物反应器机理模型配置完毕,如何确定保证机理模型的jingque性呢?下一步就需要通过准确估算机理模型中的未知参数来校准模型,并用实验数据来验证模型预测的准确性。
四种实验条件下活细胞浓度(左)和单抗滴度(右)的模型轨迹(线)和实验数据(点)
其它工艺参数的模型轨迹(线)与控制条件的实验数据(点)的对比
不同于从零开始的探索,GSK只需要用少量、有针对性的变量控制实验(如补料频率和滴度变化等),就能完成模型的参数估计工作、充分表征工艺过程。
如上图所示,该模型的拟合程度已经较高,很好地达到了GSK的理想预期。gPROMS FormulatedProducts让GSK快速明确了工艺优化方向,大大提高研发效率,减少材料和时间的浪费。
第三步:模型的应用
除了繁杂的输入、输出变量外,细胞培养过程中还会面临许多不可控因素,如环境变量和突发事件等对产品质量的影响。
如何有效评估这些因素对工艺系统的影响程度呢?这就不得不提gPROMS FormulatedProducts的GSA全局系统分析中的敏感性分析功能。
GSA利用校准好的模型充分评估CQA与CMA、CPP之间的相互关系,确定理想的工艺操作区间,以及模型中需要额外调整的区域。当然反过来,理想的操作区间确定后,也可以用于计算机虚拟实验,优化工艺条件以满足指定的模型输出,最终实现优化工艺设计的目的。
标准化后的敏感性指数总结
在gPROMS FormulatedProducts的帮助下,GSK可以很好地识别关键质量属性(CQAs)对关键工艺参数(CPPs)和关键材料属性(CMA)的敏感性,精准锁定关键工艺参数,充分探索设计空间。
依托GSA的强大功能,GSK可以按总效应指数,在计算机上对各个影响因素的敏感性进行排序。如上图所示,最终确定了与乳酸消耗和分泌相关的参数,对于模型反应的影响最大。
最终,基于gPROMS FormulatedProducts提供的cell culture动力学模型,GSK捕获了多个关键的CHO细胞培养过程变量的变化——包括葡萄糖、活细胞浓度(VCC)和滴度等。
客户收益
在实际应用过程中,GSK用计算机模拟替代繁琐实验,让工艺优化从完全以实验数据驱动,转为仅需少量实验数据的机理模型,不仅大幅节省了DoE实验的时间、材料和人工花费,打开了用更低成本实现更佳效果的全新思路。
由于gPROMS FormulatedProducts具备系统性模拟的功能,可以用于仿真系统中任一单元某变量的变化对全局系统造成的影响。
因此在工艺过程数字化中,可以有效降低突发事件、设备意外(如泵发生损坏,没有及时排出代谢副产物)等造成的负面影响,保障生产效率和药品质量达标、缩短药品上市周期。
现阶段,GSK正在继续完善模型,扩大该机理模型在优化进料策略上的应用,并不断加深对细胞生长动力学机理模型和工艺流程的理解。
gPROMS:端到端数字孪生的全局赋能
近年来,基于细胞动力学机理模型的开发方式,为从细胞培养到分离纯化的全局药物制备最优工艺探索,创造前所未有的便捷。
gPROMS FormulatedProducts工艺数字孪生为R&D、工程应用、实际生产带来了高效预测和指导,并为用户优化过程设计、风险评估、设计空间探索,带来前所未有的便捷。
系统拥有贯穿生物制药上下游的数字孪生模型
当然,作为全生命周期的仿真软件,gPROMS FormulatedProducts 的应用不只局限于生物反应器,而是能全面贯穿从上游细胞培养,下游层析过滤,到制剂的各流程。覆盖上下游的机理模型,能为生物制药企业提供一整套端到端的流程仿真解决方案。
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